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删除注册表中的exe文件关联信息后，对应的exe文件本身并不会被删除或失效。但是，这可能会导致以下问题。
1、无法直接通过文件关联打开程序，如果删除了某个程序的exe文件关联信息，那么双击该程序的快捷方式或图标时可能无法打开程序，需要手动找到exe文件的路径并指定路径打开程序。
2、影响软件的正常运行，某些软件在安装时会将注册表中的某些键值替换为自己的键值，如果删除了这些键值可能导致软件无法正常运行或无法安装，某些软件的卸载程序会检查注册表中的特定键值是否存在，如果不存在则可能无法卸载软件，删除注册表中的exe文件关联信息可能会影响软件的安装、运行和卸载。
虽然删除注册表中的exe文件关联信息不会直接删除或失效对应的exe文件本身，但可能会对软件的运行和使用造成影响，建议在删除注册表中的任何信息之前，务必谨慎考虑并确保了解操作的后果，如果不确定如何操作，建议寻求专业人士的帮助以避免不必要的麻烦。